Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Fbxo41Q6NS60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fbxo41Q6NS60 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Fbxo41Q6NS60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fbxo41Q6NS60 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fbxo41Q6NS60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fbxo41Q6NS60 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Fbxo41Q6NS60 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Fbxo41Q6NS60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Fbxo41Q6NS60 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Fbxo41Q6NS60 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Fbxo41Q6NS60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Fbxo41Q6NS60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Fbxo41Q6NS60 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Fbxo41Q6NS60 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fbxo41Q6NS60 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Fbxo41Q6NS60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Fbxo41Q6NS60 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Fbxo41Q6NS60 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fbxo41Q6NS60 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fbxo41Q6NS60 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fbxo41Q6NS60 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fbxo41Q6NS60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fbxo41Q6NS60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fbxo41Q6NS60 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fbxo41Q6NS60 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Fbxo41Q6NS60 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Fbxo41Q6NS60 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Fbxo41Q6NS60 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Fbxo41Q6NS60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Fbxo41Q6NS60 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Fbxo41Q6NS60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fbxo41Q6NS60 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Fbxo41Q6NS60 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fbxo41Q6NS60 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Fbxo41Q6NS60 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fbxo41Q6NS60 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fbxo41Q6NS60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fbxo41Q6NS60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fbxo41Q6NS60 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fbxo41Q6NS60 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fbxo41Q6NS60 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Fbxo41Q6NS60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Fbxo41Q6NS60 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fbxo41Q6NS60 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fbxo41Q6NS60 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Fbxo41Q6NS60 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fbxo41Q6NS60 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fbxo41Q6NS60 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Fbxo41Q6NS60 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fbxo41Q6NS60 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Fbxo41Q6NS60 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Fbxo41Q6NS60 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Fbxo41Q6NS60 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Fbxo41Q6NS60 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Fbxo41Q6NS60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fbxo41Q6NS60 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fbxo41Q6NS60 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fbxo41Q6NS60 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Fbxo41Q6NS60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Fbxo41Q6NS60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Fbxo41Q6NS60 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fbxo41Q6NS60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fbxo41Q6NS60 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Fbxo41Q6NS60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fbxo41Q6NS60 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fbxo41Q6NS60 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Fbxo41Q6NS60 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fbxo41Q6NS60 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fbxo41Q6NS60 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fbxo41Q6NS60 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fbxo41Q6NS60 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms