Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Pdcd11Q6NS46 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Pdcd11Q6NS46 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Pdcd11Q6NS46 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Pdcd11Q6NS46 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Pdcd11Q6NS46 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Pdcd11Q6NS46 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Pdcd11Q6NS46 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Pdcd11Q6NS46 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Pdcd11Q6NS46 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Pdcd11Q6NS46 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Pdcd11Q6NS46 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Pdcd11Q6NS46 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Pdcd11Q6NS46 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Pdcd11Q6NS46 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Pdcd11Q6NS46 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Pdcd11Q6NS46 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Pdcd11Q6NS46 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Pdcd11Q6NS46 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Pdcd11Q6NS46 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Pdcd11Q6NS46 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Pdcd11Q6NS46 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Pdcd11Q6NS46 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Pdcd11Q6NS46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Pdcd11Q6NS46 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Pdcd11Q6NS46 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Pdcd11Q6NS46 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Pdcd11Q6NS46 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Pdcd11Q6NS46 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Pdcd11Q6NS46 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Pdcd11Q6NS46 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Pdcd11Q6NS46 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Pdcd11Q6NS46 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Pdcd11Q6NS46 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Pdcd11Q6NS46 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Pdcd11Q6NS46 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Pdcd11Q6NS46 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Pdcd11Q6NS46 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Pdcd11Q6NS46 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Pdcd11Q6NS46 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Pdcd11Q6NS46 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Pdcd11Q6NS46 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Pdcd11Q6NS46 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Pdcd11Q6NS46 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Pdcd11Q6NS46 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Pdcd11Q6NS46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Pdcd11Q6NS46 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Pdcd11Q6NS46 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Pdcd11Q6NS46 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Pdcd11Q6NS46 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Pdcd11Q6NS46 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pdcd11Q6NS46 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Pdcd11Q6NS46 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Pdcd11Q6NS46 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Pdcd11Q6NS46 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Pdcd11Q6NS46 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Pdcd11Q6NS46 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pdcd11Q6NS46 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Pdcd11Q6NS46 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Pdcd11Q6NS46 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Pdcd11Q6NS46 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Pdcd11Q6NS46 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Pdcd11Q6NS46 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms