Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ParpbpQ6IRT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ParpbpQ6IRT3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ParpbpQ6IRT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ParpbpQ6IRT3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ParpbpQ6IRT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ParpbpQ6IRT3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ParpbpQ6IRT3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ParpbpQ6IRT3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ParpbpQ6IRT3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ParpbpQ6IRT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ParpbpQ6IRT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ParpbpQ6IRT3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ParpbpQ6IRT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ParpbpQ6IRT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParpbpQ6IRT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ParpbpQ6IRT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ParpbpQ6IRT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ParpbpQ6IRT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ParpbpQ6IRT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms