Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt72Q6IME9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt72Q6IME9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt72Q6IME9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt72Q6IME9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt72Q6IME9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt72Q6IME9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt72Q6IME9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt72Q6IME9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt72Q6IME9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt72Q6IME9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt72Q6IME9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt72Q6IME9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt72Q6IME9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt72Q6IME9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt72Q6IME9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt72Q6IME9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt72Q6IME9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt72Q6IME9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt72Q6IME9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms