Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt42Q6IFX2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt42Q6IFX2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt42Q6IFX2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt42Q6IFX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt42Q6IFX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt42Q6IFX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt42Q6IFX2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt42Q6IFX2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms