Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CilpQ66K08 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CilpQ66K08 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CilpQ66K08 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CilpQ66K08 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CilpQ66K08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CilpQ66K08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CilpQ66K08 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CilpQ66K08 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CilpQ66K08 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms