Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp4aQ64436 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp4aQ64436 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp4aQ64436 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp4aQ64436 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp4aQ64436 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp4aQ64436 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp4aQ64436 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp4aQ64436 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp4aQ64436 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp4aQ64436 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp4aQ64436 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp4aQ64436 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp4aQ64436 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp4aQ64436 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp4aQ64436 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp4aQ64436 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp4aQ64436 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp4aQ64436 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp4aQ64436 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp4aQ64436 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp4aQ64436 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp4aQ64436 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp4aQ64436 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp4aQ64436 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms