Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,28
Cnga2Q62398 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cnga2Q62398 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cnga2Q62398 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cnga2Q62398 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cnga2Q62398 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cnga2Q62398 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cnga2Q62398 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cnga2Q62398 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Cnga2Q62398 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cnga2Q62398 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Cnga2Q62398 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Cnga2Q62398 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cnga2Q62398 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cnga2Q62398 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cnga2Q62398 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cnga2Q62398 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cnga2Q62398 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cnga2Q62398 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cnga2Q62398 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cnga2Q62398 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cnga2Q62398 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cnga2Q62398 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cnga2Q62398 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cnga2Q62398 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cnga2Q62398 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cnga2Q62398 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Cnga2Q62398 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cnga2Q62398 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Cnga2Q62398 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cnga2Q62398 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cnga2Q62398 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cnga2Q62398 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cnga2Q62398 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Cnga2Q62398 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cnga2Q62398 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cnga2Q62398 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cnga2Q62398 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Cnga2Q62398 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Cnga2Q62398 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Cnga2Q62398 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Cnga2Q62398 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cnga2Q62398 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Cnga2Q62398 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Cnga2Q62398 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,6 ms