Protein–RNA interactions for Protein: Q61646

Hp, Haptoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpQ61646 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HpQ61646 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HpQ61646 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HpQ61646 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HpQ61646 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HpQ61646 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HpQ61646 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HpQ61646 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HpQ61646 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HpQ61646 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HpQ61646 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HpQ61646 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HpQ61646 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HpQ61646 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HpQ61646 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HpQ61646 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HpQ61646 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HpQ61646 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HpQ61646 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HpQ61646 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HpQ61646 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HpQ61646 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HpQ61646 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HpQ61646 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HpQ61646 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HpQ61646 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HpQ61646 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HpQ61646 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpQ61646 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpQ61646 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HpQ61646 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpQ61646 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpQ61646 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HpQ61646 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpQ61646 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HpQ61646 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HpQ61646 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpQ61646 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpQ61646 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpQ61646 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HpQ61646 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HpQ61646 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HpQ61646 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HpQ61646 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpQ61646 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpQ61646 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpQ61646 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpQ61646 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpQ61646 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpQ61646 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpQ61646 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpQ61646 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpQ61646 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HpQ61646 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HpQ61646 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HpQ61646 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HpQ61646 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HpQ61646 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HpQ61646 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpQ61646 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpQ61646 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpQ61646 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpQ61646 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpQ61646 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpQ61646 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpQ61646 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpQ61646 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpQ61646 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpQ61646 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpQ61646 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpQ61646 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpQ61646 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpQ61646 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpQ61646 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpQ61646 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpQ61646 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HpQ61646 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpQ61646 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpQ61646 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
HpQ61646 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpQ61646 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpQ61646 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpQ61646 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpQ61646 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpQ61646 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HpQ61646 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpQ61646 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpQ61646 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpQ61646 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpQ61646 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HpQ61646 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HpQ61646 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpQ61646 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpQ61646 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpQ61646 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpQ61646 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpQ61646 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpQ61646 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpQ61646 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HpQ61646 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms