Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxg1Q60987 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxg1Q60987 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxg1Q60987 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxg1Q60987 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxg1Q60987 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxg1Q60987 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxg1Q60987 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxg1Q60987 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxg1Q60987 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxg1Q60987 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxg1Q60987 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxg1Q60987 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxg1Q60987 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxg1Q60987 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxg1Q60987 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxg1Q60987 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxg1Q60987 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxg1Q60987 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxg1Q60987 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxg1Q60987 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxg1Q60987 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms