Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf3Q60980 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf3Q60980 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf3Q60980 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf3Q60980 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf3Q60980 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf3Q60980 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Klf3Q60980 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf3Q60980 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf3Q60980 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf3Q60980 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms