Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grik1Q60934 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grik1Q60934 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grik1Q60934 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grik1Q60934 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grik1Q60934 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grik1Q60934 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grik1Q60934 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grik1Q60934 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grik1Q60934 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grik1Q60934 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grik1Q60934 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grik1Q60934 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grik1Q60934 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grik1Q60934 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Grik1Q60934 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Grik1Q60934 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Grik1Q60934 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Grik1Q60934 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Grik1Q60934 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Grik1Q60934 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Grik1Q60934 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grik1Q60934 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grik1Q60934 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Grik1Q60934 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Grik1Q60934 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grik1Q60934 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grik1Q60934 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grik1Q60934 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grik1Q60934 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grik1Q60934 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grik1Q60934 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik1Q60934 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Grik1Q60934 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik1Q60934 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms