Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irgm1Q60766 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irgm1Q60766 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm1Q60766 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm1Q60766 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irgm1Q60766 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm1Q60766 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm1Q60766 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irgm1Q60766 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irgm1Q60766 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irgm1Q60766 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irgm1Q60766 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Irgm1Q60766 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irgm1Q60766 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irgm1Q60766 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irgm1Q60766 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irgm1Q60766 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms