Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MarcoQ60754 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MarcoQ60754 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MarcoQ60754 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MarcoQ60754 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MarcoQ60754 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MarcoQ60754 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MarcoQ60754 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MarcoQ60754 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MarcoQ60754 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MarcoQ60754 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MarcoQ60754 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MarcoQ60754 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MarcoQ60754 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MarcoQ60754 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MarcoQ60754 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MarcoQ60754 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MarcoQ60754 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MarcoQ60754 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MarcoQ60754 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MarcoQ60754 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MarcoQ60754 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MarcoQ60754 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MarcoQ60754 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MarcoQ60754 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MarcoQ60754 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MarcoQ60754 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MarcoQ60754 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MarcoQ60754 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MarcoQ60754 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MarcoQ60754 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MarcoQ60754 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MarcoQ60754 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MarcoQ60754 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MarcoQ60754 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MarcoQ60754 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MarcoQ60754 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MarcoQ60754 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MarcoQ60754 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MarcoQ60754 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MarcoQ60754 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MarcoQ60754 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MarcoQ60754 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms