Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PmelQ60696 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmelQ60696 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PmelQ60696 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PmelQ60696 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PmelQ60696 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PmelQ60696 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PmelQ60696 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PmelQ60696 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PmelQ60696 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PmelQ60696 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PmelQ60696 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PmelQ60696 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PmelQ60696 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmelQ60696 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PmelQ60696 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmelQ60696 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PmelQ60696 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PmelQ60696 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PmelQ60696 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PmelQ60696 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PmelQ60696 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PmelQ60696 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PmelQ60696 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PmelQ60696 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PmelQ60696 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PmelQ60696 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PmelQ60696 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmelQ60696 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PmelQ60696 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmelQ60696 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PmelQ60696 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PmelQ60696 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PmelQ60696 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmelQ60696 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmelQ60696 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmelQ60696 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms