Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc1Q60596 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrcc1Q60596 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrcc1Q60596 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrcc1Q60596 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrcc1Q60596 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrcc1Q60596 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc1Q60596 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc1Q60596 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc1Q60596 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc1Q60596 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc1Q60596 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc1Q60596 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc1Q60596 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xrcc1Q60596 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc1Q60596 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc1Q60596 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc1Q60596 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc1Q60596 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc1Q60596 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc1Q60596 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrcc1Q60596 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc1Q60596 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc1Q60596 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc1Q60596 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc1Q60596 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc1Q60596 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc1Q60596 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc1Q60596 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc1Q60596 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc1Q60596 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Xrcc1Q60596 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc1Q60596 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc1Q60596 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc1Q60596 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrcc1Q60596 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Xrcc1Q60596 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xrcc1Q60596 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Xrcc1Q60596 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc1Q60596 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xrcc1Q60596 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc1Q60596 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrcc1Q60596 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc1Q60596 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Xrcc1Q60596 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc1Q60596 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xrcc1Q60596 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms