Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Sin3aQ60520 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Sin3aQ60520 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sin3aQ60520 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sin3aQ60520 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sin3aQ60520 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sin3aQ60520 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sin3aQ60520 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sin3aQ60520 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Sin3aQ60520 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Sin3aQ60520 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sin3aQ60520 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sin3aQ60520 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sin3aQ60520 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sin3aQ60520 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Sin3aQ60520 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sin3aQ60520 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Sin3aQ60520 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Sin3aQ60520 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sin3aQ60520 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Sin3aQ60520 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Sin3aQ60520 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sin3aQ60520 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sin3aQ60520 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sin3aQ60520 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sin3aQ60520 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sin3aQ60520 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sin3aQ60520 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Sin3aQ60520 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Sin3aQ60520 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sin3aQ60520 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sin3aQ60520 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sin3aQ60520 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sin3aQ60520 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sin3aQ60520 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sin3aQ60520 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sin3aQ60520 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sin3aQ60520 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Sin3aQ60520 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Sin3aQ60520 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sin3aQ60520 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sin3aQ60520 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sin3aQ60520 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sin3aQ60520 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Sin3aQ60520 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sin3aQ60520 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sin3aQ60520 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sin3aQ60520 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sin3aQ60520 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sin3aQ60520 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Sin3aQ60520 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sin3aQ60520 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sin3aQ60520 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sin3aQ60520 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sin3aQ60520 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Sin3aQ60520 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sin3aQ60520 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sin3aQ60520 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sin3aQ60520 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms