Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clec4a4Q5YIR8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4a4Q5YIR8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4a4Q5YIR8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4a4Q5YIR8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clec4a4Q5YIR8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clec4a4Q5YIR8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clec4a4Q5YIR8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clec4a4Q5YIR8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clec4a4Q5YIR8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clec4a4Q5YIR8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec4a4Q5YIR8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec4a4Q5YIR8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec4a4Q5YIR8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec4a4Q5YIR8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec4a4Q5YIR8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clec4a4Q5YIR8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4a4Q5YIR8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec4a4Q5YIR8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec4a4Q5YIR8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec4a4Q5YIR8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec4a4Q5YIR8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec4a4Q5YIR8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4a4Q5YIR8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4a4Q5YIR8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4a4Q5YIR8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec4a4Q5YIR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec4a4Q5YIR8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec4a4Q5YIR8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec4a4Q5YIR8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec4a4Q5YIR8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clec4a4Q5YIR8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4a4Q5YIR8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms