Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav6-2Q5R1I4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trav6-2Q5R1I4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trav6-2Q5R1I4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trav6-2Q5R1I4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav6-2Q5R1I4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav6-2Q5R1I4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trav6-2Q5R1I4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trav6-2Q5R1I4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trav6-2Q5R1I4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trav6-2Q5R1I4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trav6-2Q5R1I4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trav6-2Q5R1I4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trav6-2Q5R1I4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trav6-2Q5R1I4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trav6-2Q5R1I4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav6-2Q5R1I4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trav6-2Q5R1I4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav6-2Q5R1I4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav6-2Q5R1I4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trav6-2Q5R1I4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms