Protein–RNA interactions for Protein: Q50H33

Kctd8, BTB/POZ domain-containing protein KCTD8, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd8Q50H33 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kctd8Q50H33 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd8Q50H33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd8Q50H33 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd8Q50H33 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd8Q50H33 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd8Q50H33 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd8Q50H33 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kctd8Q50H33 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kctd8Q50H33 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kctd8Q50H33 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kctd8Q50H33 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kctd8Q50H33 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kctd8Q50H33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd8Q50H33 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd8Q50H33 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kctd8Q50H33 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kctd8Q50H33 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kctd8Q50H33 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kctd8Q50H33 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kctd8Q50H33 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kctd8Q50H33 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kctd8Q50H33 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kctd8Q50H33 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kctd8Q50H33 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kctd8Q50H33 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kctd8Q50H33 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kctd8Q50H33 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kctd8Q50H33 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kctd8Q50H33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Kctd8Q50H33 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kctd8Q50H33 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd8Q50H33 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms