Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al1nQ497L1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al1nQ497L1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al1nQ497L1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al1nQ497L1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2al1nQ497L1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2al1nQ497L1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1nQ497L1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1nQ497L1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms