Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D13Ertd608eQ3UPR8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms