Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP23

Tmem26, Transmembrane protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem26Q3UP23 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem26Q3UP23 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmem26Q3UP23 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem26Q3UP23 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmem26Q3UP23 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem26Q3UP23 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem26Q3UP23 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem26Q3UP23 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem26Q3UP23 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem26Q3UP23 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem26Q3UP23 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem26Q3UP23 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmem26Q3UP23 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem26Q3UP23 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem26Q3UP23 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem26Q3UP23 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem26Q3UP23 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem26Q3UP23 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem26Q3UP23 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem26Q3UP23 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem26Q3UP23 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem26Q3UP23 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmem26Q3UP23 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmem26Q3UP23 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmem26Q3UP23 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmem26Q3UP23 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmem26Q3UP23 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem26Q3UP23 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms