Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Greb1Q3UHK3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Greb1Q3UHK3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Greb1Q3UHK3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Greb1Q3UHK3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Greb1Q3UHK3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Greb1Q3UHK3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Greb1Q3UHK3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Greb1Q3UHK3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Greb1Q3UHK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Greb1Q3UHK3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Greb1Q3UHK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Greb1Q3UHK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Greb1Q3UHK3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Greb1Q3UHK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Greb1Q3UHK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Greb1Q3UHK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms