Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccser2Q3UHI0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccser2Q3UHI0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccser2Q3UHI0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccser2Q3UHI0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccser2Q3UHI0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccser2Q3UHI0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccser2Q3UHI0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccser2Q3UHI0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccser2Q3UHI0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccser2Q3UHI0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccser2Q3UHI0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccser2Q3UHI0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccser2Q3UHI0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccser2Q3UHI0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccser2Q3UHI0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccser2Q3UHI0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccser2Q3UHI0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccser2Q3UHI0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccser2Q3UHI0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccser2Q3UHI0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccser2Q3UHI0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccser2Q3UHI0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccser2Q3UHI0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccser2Q3UHI0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccser2Q3UHI0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccser2Q3UHI0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms