Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rsph3aQ3UFY4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rsph3aQ3UFY4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rsph3aQ3UFY4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rsph3aQ3UFY4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rsph3aQ3UFY4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rsph3aQ3UFY4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rsph3aQ3UFY4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rsph3aQ3UFY4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rsph3aQ3UFY4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rsph3aQ3UFY4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rsph3aQ3UFY4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rsph3aQ3UFY4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rsph3aQ3UFY4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rsph3aQ3UFY4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rsph3aQ3UFY4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rsph3aQ3UFY4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rsph3aQ3UFY4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rsph3aQ3UFY4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rsph3aQ3UFY4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rsph3aQ3UFY4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rsph3aQ3UFY4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rsph3aQ3UFY4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rsph3aQ3UFY4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsph3aQ3UFY4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsph3aQ3UFY4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms