Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LbrQ3U9G9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LbrQ3U9G9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LbrQ3U9G9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LbrQ3U9G9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LbrQ3U9G9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LbrQ3U9G9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LbrQ3U9G9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LbrQ3U9G9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LbrQ3U9G9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LbrQ3U9G9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LbrQ3U9G9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LbrQ3U9G9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LbrQ3U9G9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LbrQ3U9G9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LbrQ3U9G9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LbrQ3U9G9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LbrQ3U9G9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LbrQ3U9G9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LbrQ3U9G9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LbrQ3U9G9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LbrQ3U9G9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LbrQ3U9G9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LbrQ3U9G9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LbrQ3U9G9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LbrQ3U9G9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LbrQ3U9G9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms