Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pag1Q3U1F9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pag1Q3U1F9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pag1Q3U1F9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pag1Q3U1F9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pag1Q3U1F9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pag1Q3U1F9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pag1Q3U1F9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pag1Q3U1F9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pag1Q3U1F9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pag1Q3U1F9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pag1Q3U1F9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pag1Q3U1F9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pag1Q3U1F9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pag1Q3U1F9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pag1Q3U1F9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pag1Q3U1F9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pag1Q3U1F9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pag1Q3U1F9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pag1Q3U1F9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms