Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ccdc174Q3U155 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ccdc174Q3U155 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc174Q3U155 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc174Q3U155 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ccdc174Q3U155 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccdc174Q3U155 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,89■■■□□ 2,37
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ccdc174Q3U155 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccdc174Q3U155 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ccdc174Q3U155 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ccdc174Q3U155 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ccdc174Q3U155 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Ccdc174Q3U155 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ccdc174Q3U155 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ccdc174Q3U155 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ccdc174Q3U155 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ccdc174Q3U155 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Ccdc174Q3U155 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ccdc174Q3U155 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ccdc174Q3U155 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ccdc174Q3U155 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Ccdc174Q3U155 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ccdc174Q3U155 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ccdc174Q3U155 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ccdc174Q3U155 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ccdc174Q3U155 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Ccdc174Q3U155 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ccdc174Q3U155 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ccdc174Q3U155 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ccdc174Q3U155 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ccdc174Q3U155 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ccdc174Q3U155 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ccdc174Q3U155 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ccdc174Q3U155 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ccdc174Q3U155 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ccdc174Q3U155 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ccdc174Q3U155 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ccdc174Q3U155 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ccdc174Q3U155 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ccdc174Q3U155 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc174Q3U155 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc174Q3U155 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,4 ms