Protein–RNA interactions for Protein: Q3U132

Tespa1, Protein TESPA1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tespa1Q3U132 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tespa1Q3U132 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tespa1Q3U132 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tespa1Q3U132 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tespa1Q3U132 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tespa1Q3U132 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tespa1Q3U132 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tespa1Q3U132 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tespa1Q3U132 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tespa1Q3U132 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tespa1Q3U132 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tespa1Q3U132 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tespa1Q3U132 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tespa1Q3U132 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tespa1Q3U132 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tespa1Q3U132 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tespa1Q3U132 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tespa1Q3U132 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tespa1Q3U132 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tespa1Q3U132 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tespa1Q3U132 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tespa1Q3U132 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tespa1Q3U132 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tespa1Q3U132 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tespa1Q3U132 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tespa1Q3U132 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tespa1Q3U132 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tespa1Q3U132 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tespa1Q3U132 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tespa1Q3U132 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tespa1Q3U132 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tespa1Q3U132 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tespa1Q3U132 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tespa1Q3U132 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms