Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc102aQ3TMW1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc102aQ3TMW1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc102aQ3TMW1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc102aQ3TMW1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc102aQ3TMW1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc102aQ3TMW1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc102aQ3TMW1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc102aQ3TMW1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc102aQ3TMW1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc102aQ3TMW1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms