Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam107bQ3TGF2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam107bQ3TGF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam107bQ3TGF2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam107bQ3TGF2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam107bQ3TGF2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam107bQ3TGF2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam107bQ3TGF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam107bQ3TGF2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam107bQ3TGF2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam107bQ3TGF2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam107bQ3TGF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam107bQ3TGF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam107bQ3TGF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam107bQ3TGF2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam107bQ3TGF2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam107bQ3TGF2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam107bQ3TGF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam107bQ3TGF2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam107bQ3TGF2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam107bQ3TGF2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam107bQ3TGF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam107bQ3TGF2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam107bQ3TGF2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms