Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Vmn1r181Q0P547 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21,3■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Vmn1r181Q0P547 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Vmn1r181Q0P547 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Vmn1r181Q0P547 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Vmn1r181Q0P547 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Vmn1r181Q0P547 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Vmn1r181Q0P547 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Vmn1r181Q0P547 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Vmn1r181Q0P547 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Vmn1r181Q0P547 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Vmn1r181Q0P547 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,13■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,08■□□□□ 0,97
Vmn1r181Q0P547 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,02■□□□□ 0,96
Vmn1r181Q0P547 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20,97■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Vmn1r181Q0P547 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,1 ms