Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thbs3Q05895 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thbs3Q05895 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thbs3Q05895 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thbs3Q05895 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thbs3Q05895 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thbs3Q05895 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thbs3Q05895 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thbs3Q05895 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thbs3Q05895 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thbs3Q05895 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs3Q05895 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Thbs3Q05895 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thbs3Q05895 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thbs3Q05895 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thbs3Q05895 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thbs3Q05895 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs3Q05895 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs3Q05895 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs3Q05895 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs3Q05895 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs3Q05895 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs3Q05895 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms