Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgfr4Q03142 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgfr4Q03142 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgfr4Q03142 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgfr4Q03142 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgfr4Q03142 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgfr4Q03142 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgfr4Q03142 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgfr4Q03142 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgfr4Q03142 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgfr4Q03142 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgfr4Q03142 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgfr4Q03142 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fgfr4Q03142 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fgfr4Q03142 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fgfr4Q03142 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fgfr4Q03142 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fgfr4Q03142 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fgfr4Q03142 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fgfr4Q03142 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fgfr4Q03142 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fgfr4Q03142 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgfr4Q03142 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgfr4Q03142 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgfr4Q03142 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fgfr4Q03142 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fgfr4Q03142 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fgfr4Q03142 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fgfr4Q03142 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fgfr4Q03142 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgfr4Q03142 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Fgfr4Q03142 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgfr4Q03142 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms