Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb5P99024 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb5P99024 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb5P99024 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb5P99024 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubb5P99024 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubb5P99024 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb5P99024 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb5P99024 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb5P99024 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb5P99024 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb5P99024 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb5P99024 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb5P99024 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubb5P99024 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb5P99024 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb5P99024 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb5P99024 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb5P99024 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb5P99024 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb5P99024 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb5P99024 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb5P99024 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms