Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Nbr1P97432 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Nbr1P97432 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Nbr1P97432 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Nbr1P97432 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Nbr1P97432 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Nbr1P97432 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Nbr1P97432 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Nbr1P97432 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Nbr1P97432 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Nbr1P97432 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Nbr1P97432 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Nbr1P97432 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Nbr1P97432 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Nbr1P97432 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nbr1P97432 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Nbr1P97432 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Nbr1P97432 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nbr1P97432 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Nbr1P97432 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Nbr1P97432 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nbr1P97432 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nbr1P97432 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nbr1P97432 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Nbr1P97432 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Nbr1P97432 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Nbr1P97432 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,89■■■□□ 2,37
Nbr1P97432 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nbr1P97432 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nbr1P97432 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Nbr1P97432 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Nbr1P97432 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Nbr1P97432 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Nbr1P97432 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Nbr1P97432 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Nbr1P97432 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Nbr1P97432 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nbr1P97432 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Nbr1P97432 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Nbr1P97432 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Nbr1P97432 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Nbr1P97432 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Nbr1P97432 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Nbr1P97432 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Nbr1P97432 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Nbr1P97432 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Nbr1P97432 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Nbr1P97432 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Nbr1P97432 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Nbr1P97432 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Nbr1P97432 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Nbr1P97432 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Nbr1P97432 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Nbr1P97432 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Nbr1P97432 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Nbr1P97432 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Nbr1P97432 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Nbr1P97432 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Nbr1P97432 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Nbr1P97432 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,8 ms