Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sparcl1P70663 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sparcl1P70663 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sparcl1P70663 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sparcl1P70663 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sparcl1P70663 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sparcl1P70663 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sparcl1P70663 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sparcl1P70663 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sparcl1P70663 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sparcl1P70663 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sparcl1P70663 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sparcl1P70663 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sparcl1P70663 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Sparcl1P70663 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sparcl1P70663 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sparcl1P70663 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sparcl1P70663 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sparcl1P70663 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sparcl1P70663 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sparcl1P70663 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sparcl1P70663 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sparcl1P70663 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sparcl1P70663 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sparcl1P70663 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sparcl1P70663 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sparcl1P70663 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sparcl1P70663 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sparcl1P70663 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sparcl1P70663 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sparcl1P70663 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sparcl1P70663 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sparcl1P70663 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sparcl1P70663 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sparcl1P70663 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sparcl1P70663 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sparcl1P70663 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sparcl1P70663 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sparcl1P70663 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sparcl1P70663 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sparcl1P70663 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sparcl1P70663 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sparcl1P70663 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sparcl1P70663 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms