Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psmb7P70195 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psmb7P70195 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psmb7P70195 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Psmb7P70195 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psmb7P70195 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmb7P70195 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmb7P70195 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmb7P70195 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmb7P70195 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmb7P70195 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psmb7P70195 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psmb7P70195 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Psmb7P70195 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psmb7P70195 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Psmb7P70195 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmb7P70195 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmb7P70195 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Psmb7P70195 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Psmb7P70195 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Psmb7P70195 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psmb7P70195 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Psmb7P70195 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms