Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Capza3P70190 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Capza3P70190 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Capza3P70190 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Capza3P70190 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Capza3P70190 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Capza3P70190 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capza3P70190 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Capza3P70190 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Capza3P70190 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Capza3P70190 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Capza3P70190 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Capza3P70190 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capza3P70190 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capza3P70190 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capza3P70190 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capza3P70190 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Capza3P70190 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Capza3P70190 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capza3P70190 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capza3P70190 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Capza3P70190 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Capza3P70190 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Capza3P70190 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capza3P70190 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capza3P70190 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Capza3P70190 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Capza3P70190 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Capza3P70190 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Capza3P70190 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Capza3P70190 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Capza3P70190 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capza3P70190 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capza3P70190 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capza3P70190 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capza3P70190 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capza3P70190 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capza3P70190 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capza3P70190 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capza3P70190 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capza3P70190 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Capza3P70190 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capza3P70190 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Capza3P70190 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Capza3P70190 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Capza3P70190 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms