Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacng7P62956 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacng7P62956 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacng7P62956 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacng7P62956 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacng7P62956 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacng7P62956 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacng7P62956 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacng7P62956 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacng7P62956 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng7P62956 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacng7P62956 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms