Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl39P62892 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl39P62892 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl39P62892 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rpl39P62892 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl39P62892 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms