Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps18P62270 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps18P62270 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps18P62270 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps18P62270 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps18P62270 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps18P62270 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps18P62270 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps18P62270 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rps18P62270 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps18P62270 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps18P62270 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps18P62270 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps18P62270 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps18P62270 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps18P62270 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps18P62270 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps18P62270 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps18P62270 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps18P62270 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps18P62270 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps18P62270 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps18P62270 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rps18P62270 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps18P62270 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps18P62270 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps18P62270 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps18P62270 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps18P62270 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps18P62270 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps18P62270 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps18P62270 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps18P62270 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps18P62270 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps18P62270 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps18P62270 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps18P62270 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps18P62270 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps18P62270 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps18P62270 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps18P62270 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps18P62270 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps18P62270 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms