Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufm1P61961 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufm1P61961 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufm1P61961 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufm1P61961 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufm1P61961 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ufm1P61961 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufm1P61961 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufm1P61961 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ufm1P61961 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufm1P61961 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufm1P61961 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufm1P61961 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufm1P61961 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufm1P61961 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufm1P61961 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufm1P61961 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ufm1P61961 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufm1P61961 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms