Protein–RNA interactions for Protein: P61922

Abat, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbatP61922 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AbatP61922 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AbatP61922 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AbatP61922 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AbatP61922 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AbatP61922 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AbatP61922 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AbatP61922 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AbatP61922 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AbatP61922 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AbatP61922 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AbatP61922 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AbatP61922 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AbatP61922 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AbatP61922 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AbatP61922 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AbatP61922 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AbatP61922 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AbatP61922 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AbatP61922 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AbatP61922 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AbatP61922 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AbatP61922 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AbatP61922 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AbatP61922 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AbatP61922 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AbatP61922 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AbatP61922 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AbatP61922 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AbatP61922 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AbatP61922 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AbatP61922 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AbatP61922 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AbatP61922 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AbatP61922 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AbatP61922 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AbatP61922 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AbatP61922 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AbatP61922 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AbatP61922 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AbatP61922 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AbatP61922 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AbatP61922 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AbatP61922 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AbatP61922 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AbatP61922 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AbatP61922 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AbatP61922 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AbatP61922 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AbatP61922 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AbatP61922 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AbatP61922 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AbatP61922 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AbatP61922 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AbatP61922 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AbatP61922 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AbatP61922 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AbatP61922 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AbatP61922 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AbatP61922 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AbatP61922 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AbatP61922 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AbatP61922 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AbatP61922 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AbatP61922 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AbatP61922 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AbatP61922 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AbatP61922 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AbatP61922 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AbatP61922 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AbatP61922 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AbatP61922 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AbatP61922 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AbatP61922 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AbatP61922 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AbatP61922 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AbatP61922 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AbatP61922 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AbatP61922 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AbatP61922 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AbatP61922 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AbatP61922 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AbatP61922 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AbatP61922 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AbatP61922 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AbatP61922 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AbatP61922 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AbatP61922 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AbatP61922 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AbatP61922 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AbatP61922 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AbatP61922 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AbatP61922 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AbatP61922 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AbatP61922 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AbatP61922 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AbatP61922 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AbatP61922 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AbatP61922 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AbatP61922 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms