Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme3P61290 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme3P61290 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme3P61290 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme3P61290 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme3P61290 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme3P61290 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psme3P61290 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psme3P61290 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme3P61290 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme3P61290 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psme3P61290 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psme3P61290 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme3P61290 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme3P61290 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme3P61290 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme3P61290 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme3P61290 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme3P61290 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme3P61290 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme3P61290 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme3P61290 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme3P61290 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme3P61290 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme3P61290 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme3P61290 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme3P61290 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme3P61290 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme3P61290 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme3P61290 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme3P61290 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme3P61290 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme3P61290 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms