Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arf3P61205 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arf3P61205 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arf3P61205 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arf3P61205 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arf3P61205 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arf3P61205 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arf3P61205 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf3P61205 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arf3P61205 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Arf3P61205 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arf3P61205 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arf3P61205 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arf3P61205 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arf3P61205 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arf3P61205 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arf3P61205 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arf3P61205 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arf3P61205 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arf3P61205 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arf3P61205 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arf3P61205 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arf3P61205 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arf3P61205 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arf3P61205 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arf3P61205 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arf3P61205 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arf3P61205 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Arf3P61205 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arf3P61205 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arf3P61205 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arf3P61205 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arf3P61205 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arf3P61205 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arf3P61205 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arf3P61205 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arf3P61205 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Arf3P61205 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arf3P61205 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arf3P61205 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms