Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2iP60898 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2iP60898 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2iP60898 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2iP60898 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2iP60898 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2iP60898 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2iP60898 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2iP60898 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2iP60898 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2iP60898 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2iP60898 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2iP60898 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2iP60898 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2iP60898 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2iP60898 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2iP60898 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2iP60898 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2iP60898 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms