Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b6P59708 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b6P59708 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b6P59708 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b6P59708 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b6P59708 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b6P59708 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b6P59708 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b6P59708 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b6P59708 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b6P59708 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms