Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrn4P59383 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4P59383 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4P59383 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn4P59383 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrn4P59383 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrn4P59383 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn4P59383 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrn4P59383 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrn4P59383 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn4P59383 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn4P59383 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn4P59383 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrn4P59383 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4P59383 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4P59383 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn4P59383 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn4P59383 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn4P59383 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn4P59383 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrn4P59383 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrn4P59383 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrn4P59383 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrn4P59383 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrn4P59383 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn4P59383 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrn4P59383 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn4P59383 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn4P59383 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn4P59383 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn4P59383 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn4P59383 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrn4P59383 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrn4P59383 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrn4P59383 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrn4P59383 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrn4P59383 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrn4P59383 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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